« Skånsk bloggaremiddag/-lunch | Main | Expedition Robinson äntligen slut »

december 02, 2004

Livets logik och geners ordning

Swedish Research News skriver rapporterar om ett pressmeddelande från Lunds universitet The logic of life brings order to our genes

It is tricky enough to get a soccer team of eleven players to cooperate and work as one – but what would it be like if there were 25,000 players on the field? What would the rules be like, and how many referees would it take to make sure that the rules were followed? As it happens, our genomes consist of networks of roughly 25,000 interacting genes, and these networks are obviously very stable and resilient to changed conditions. Out of billions of cells, not a single one falls into chaos. How can order be maintained?

This is a question that scientists have been pondering since the 1960s, and it may now have been answered by theoretical physicists at Lund University. In the most recent issue of the Proceedings of the National Academy of Sciences USA, professor Carsten Peterson and his collaborators Björn Samuelsson and Carl Troein demonstrate how this is possible [...]. The American physician and scientist Stuart Kauffman – a pioneer in the field, who formulated and attempted to solve the problem as early as 1967 – is their co-author.


Papret som refereras är
Stuart Kauffman, Carsten Peterson, Björn Samuelsson, Carl Troein: Genetic networks with canalyzing Boolean rules are always stable (PDF)


Se vidare
Stuart Kauffman
Carsten Peterson
Björn Samuelsson
Carl Troein
(De tre sistnämnda från Avdelningen för teoretisk fysik i Lund)

Se även Livets logik ger ordning åt gener (forskning.se)

Posted by hakank at december 2, 2004 07:48 EM Posted to Komplexitet/emergens

Comments

Bara för att vara klart, det är inte jag som skrev texten -- det är en persmeddelande, som vanligt på Swedish Research News.

Posted by: Stefan Geens at december 2, 2004 10:47 EM

Stefan, jag ändrade i texten. Hoppas det blev mer korrekt.


Posted by: hakank [TypeKey Profile Page] at december 2, 2004 11:20 EM

Hmm, har för mig att jag hört dem prata om det. Men de har ju bara använt booleanska nätverk. Hur funkar det med det ickelinjära kontinuerliga nätverk?

Posted by: Kristofer at december 3, 2004 08:10 FM

Det trevliga med den typ av stabilitetsmått vi tittat på är att de är så okänsliga för detaljer i modellen. Man kan se det som att om inget händer spelar det inte någon roll i vilken ordning man gör saker eller vad exakt man gör.

Att gå till en kontinuerlig modell hade varit motiverat, men man måste först reda ut vad den kontinuerliga motsvarigheten till nästlat kanaliserande regler skulle vara. Vi jobbar nu med en kontinuerlig modell som utgår från hur genreglering fungerar på molekylnivå och där nätverken har ett riktigt jobb att utföra. Får se vart det leder.

[...och så en hälsning till gamla /netch/are där ute. Jag sommarjobbade där 99 (med telia) och 2000 (med f-nglobe).]

Posted by: Carl Troein at augusti 2, 2005 01:06 EM